La saga del CP9 è la quarta grande saga della serie. Dopo essere partita da Skypiea, la ciurma torna nel mare blu, dove affronta Foxy nel Davy Back Fight e poco dopo l'ammiraglio Aokiji. Dopo essere scampati alla sconfitta, i Pirati di Cappello di paglia raggiungono Water Seven, la città dei carpentieri, dove Rufy spera di riuscire a reclutarne uno.
Finiscono subito nei guai, attirandosi l'odio sia della Franky Family, un gruppo di smantellatori, sia della Galley-La company, una compagnia navale che vanta i migliori carpentieri al mondo. Scoprono che la Going Merry non potrà più navigare e Rufy decide di comprare una nuova nave. Usop, amareggiato, lascia la ciurma. Nel frattempo il CP9 costringe Robin a seguirla ad Enies Lobby, ma i Pirati di Cappello di paglia e i loro nuovi alleati la inseguono per poterla riportare indietro. La ciurma riesce nel suo intento e nel frattempo ottiene un nuovo membro dell'equipaggio: Franky, il loro nuovo carpentiere, che gli costruisce una nuova nave, la Thousand Sunny. Mentre stanno ripartendo, Usop chiede scusa e torna nel gruppo.
Saghe contenute[]
- Saga del Davy Back Fight
- Manga: 2004
- Anime: 2004-2005
- Saga dell'isola del ladro di ricordi (filler)
- Anime: 2005
- Saga del ritorno di Foxy (filler)
- Anime: 2005
- Saga di Water Seven
- Manga: 2004-2005
- Anime: 2005-2006
- Saga di Enies Lobby
- Manga: 2005-2006
- Anime: 2006-2007
- Saga dopo Enies Lobby
- Manga: 2006-2007
- Anime: 2007