La saga della Baroque Works è la seconda grande saga della serie. Racconta come i Pirati di Cappello di paglia aiutino la principessa Nefertari Bibi a raggiungere il regno di Alabasta prima che scoppi una guerra civile. Durante il viaggio un'organizzazione segreta di nome Baroque Works cerca di fermarli in tutti i modi.
I protagonisti reclutano un altro membro, la renna dottore TonyTony Chopper, e fanno la conoscenza del fratello del loro capitano, Portuguese D. Ace. La saga si conclude con un confronto a viso aperto con gli agenti più forti della Baroque Works, guidata da Mr. Zero alias Crocodile, uno della Flotta dei sette.
Nico Robin si unisce all'equipaggio, mentre Bibi rimane ad Alabasta.
Saghe contenute[]
- Saga di Lovoon
- Manga: 1999
- Anime: 2001
- Saga di Whisky Peak
- Manga: 1999
- Anime: 2001
- Saga di Little Garden
- Manga: 2000
- Anime: 2001
- Saga di Drum
- Manga: 2000
- Anime: 2001
- Saga di Alabasta
- Manga: 2000-2002
- Anime: 2001-2002
- Saga dopo Alabasta (filler)
- Anime: 2002